La gran cúpula de 12 metres de diàmetre que governa el vestíbul del Mercat és obra de l’artista mallorquí Miquel Barceló. L’any 1990, el Consistori va iniciar l’ampliació del Mercat de les Flors incorporant una nova sala, l’Espai B, contigua a l’edifici central del Mercat i que posteriorment s’anomenaria Sala Ovidi Montllor. Aquest espai va ser enderrocat amb la construcció de l’edifici de l’Institut del Teatre, que va crear una nova sala dins de les seves instal•lacions amb el mateix nom i que actualment comparteix l’exhibició amb el Mercat. Així doncs, existeixen quatre sales amb programació continuada: la Sala Maria Aurèlia Capmany, la Sala Ovidi Montllor i les sales Sebastià Gasch i Pina Bausch, que acullen activitats de petit format.
El teatre, des dels seus inicis, ha volgut ser un referent de l’escena en tot tipus d’expressió creativa: el teatre, la dansa, la música, les performances, l’art mèdia… Directors com el ja anomenat Peter Brook, Luca Ronconi, Peter Stein, Patrice Chéreau, Carlos Marqueríe, Robert Lepage, Tadeusz Kantor, Anatoli Vassiliev, Mario Gas, Calixto Bieito, Roger Bernat, companyies nacionals com La Fura dels Baus, Comediants, Els Joglars, la Cubana, Sèmola Teatre, Sol Picó, Mal Pelo, Àngels Margarit, La Carnicería Teatro, Teatro de la Abadía, internacionals com Phillipe Genty, Wim Vandekeybus, La la la Human Steps, Rosas, festivals com ArtFutura, el Festival Àsia o Primavera Sound, cinema amb la presència de directors com Fernando Trueba, Fernando León, Joaquim Oristrell o Jaume Balagueró, música amb La Paquera de Jerez, Carlos Santos, Georges Moustaki i tants i tants altres han fet del Mercat de les Flors un referent de l’escena i la creació contemporània del nostre país. Durant la seva trajectòria han dirigit el Mercat Joan Mª Gual (en dues etapes), Elena Posa, Andreu Morte (també en dues ocasions) i Francesc Casadesús. L’actual directora és Àngels Margarit. El Mercat de les Flors forma part dels equipaments que configuren la Ciutat del Teatre, on la plaça Margarita Xirgu vertebra els tres espais teatrals: el mateix Mercat, el Teatre Lliure i l’Institut del Teatre.